После заражения, по прошествии определенного скрытого периода заболевания, во время которого происходит накопление вируса, возникают признаки болезни. Длительность скрытого периода в каждом отдельном случае различна, чаще всего составляет 7-14 дней. Может быть как очень короткой - несколько дней, так и продолжаться почти месяц.
На территории России тяжесть клещевого энцефалита отличается в различных регионах. Так наиболее легкое течение регистрируется у больных в западных областях, на Дальнем Востоке заболевание протекает наиболее тяжело. Обычно заболевание начинается внезапно.
Повышается температура тела, которая сопровождается чувством жара или озноба. Больного беспокоит нарастающая общая слабость, ломота в теле. Почти всегда возникает головная боль, обычно сильно выраженная.
В это же время у больного может быть тошнота и неоднократная рвота, которая не приносит облегчения. Повышенная температура тела обычно сохраняется около недели, затем она снижается до нормы или бывает незначительно повышенной. Общее состояние значительно улучшается и создается впечатление выздоровления.
Однако через несколько дней возникает новый подъем температуры, усиливаются все бывшие симптомы или появляются новые и болезнь как бы повторяется. У некоторых больных все эти проявления болезни составляют основную картину заболевания, и обычно других симптомов не появляется на всем дальнейшем протяжении болезни.
Однако, часто вскоре после повышения температуры появляются признаки, свидетельствующие о поражении центральной нервной системы. Вирус поражает мягкую мозговую оболочку, серое вещество (кору) головного мозга, двигательные нейроны спинного мозга и периферические нервы.
Появляется слабость в руке или ноге вплоть до полной невозможности совершать движения, причем иногда поражаются ноги и руки одновременно. При развитии подобных параличей в мышцах шеи наблюдается типичная картина для клещевого энцефалита - "свисающая голова", когда больной не может самостоятельно удерживать голову.
Проявления энцефалита сопровождаются сонливостью, может наблюдаться бред, галлюцинации, двигательное возбуждение больных, иногда развиваются судороги. Достаточно характерным признаком клещевого энцефалита являются непроизвольные подергивания отдельных групп мышц. Может наблюдаться чувство онемения кожи в отдельных областях тела.
Иногда наблюдается нарушение глотания. Могут отмечаться нарушения сердечно-сосудистой системы (миокардит, сердечно-сосудистая недостаточность, аритмия), пищеварительной системы - задержка стула, увеличение печени и селезенки.
Все эти проявления не связаны с непосредственным поражением нервной системы и, как правило, сочетаются с неврологическими симптомами на фоне высокой лихорадки.